El siniestro se suscitó a las 09:28 horas del 28 de diciembre de 2025, cuando una de las locomotoras y varios vagones del convoy, que transportaba a 250 pasajeros, salieron de la vía mientras circulaba sobre la Línea Z.
El gobernador Salomón Jara informó que 15 personas resultaron lesionadas tras el descarrilamiento del Tren Interoceánico en Asunción Ixtaltepec; las autoridades activaron protocolos de emergencia y atención médica inmediata.