Aun con más votación lograda por sus candidatos a diputados federales, en comparación con los resultados obtenidos en la elección intermedia de 2015, el Partido Acción Nacional perdió todas las diputaciones federales en Baja California, estado que gobierna desde 1989 y donde había mantenido cierta dominancia electoral hasta el arrase del Movimiento de Regeneración Nacional (MORENA) del domingo 1 de julio cuando el partido de Andrés Manuel López Obrador se llevó carro completo en el estado.
La peor derrota en un distrito para el Partido Acción Nacional, fue en el distrito 4 de Tijuana, donde la candidata de Morena se alzó en la victoria con 80 mil 368 votos, logrando el 70 por ciento de la votación a su favor, contra escasos 19 mil 450 sufragios a favor del ex Secretario de Desarrollo Social del Estado, Ricardo Magaña Mosqueda, para dejar al PAN con un 16 por ciento de la votación en esa demarcación, con el 65 por ciento de las actas computadas en el conteo preliminar del Instituto Nacional Electoral.
En realidad, Morena registró votaciones altísimas en comparación con elecciones federales pasadas en Baja California. Por ejemplo en el 2012 el candidato a diputado federal del PAN que más votos obtuvo fue el actual alcalde de Tijuana, Juan Manuel Gastélum Buenrostro quien apenas superó los 46 mil sufragios a su favor y con eso fue suficiente para ganar. En esta elección, la panista que más votos generó fue Rosalba López Regalado del distrito 5, con 37 mil sufragios a su favor, muy por debajo de los 75 mil 752 votos obtenidos por Mario Ismael Moreno Gil de la alianza Juntos Haremos Historia, quien obtiene el 55 por ciento de la votación con 73 por ciento de las casillas computadas de acuerdo al PREP del INE.
En general, los candidatos a diputados de Morena en los ocho distritos electorales federales de Baja California, alcanzaron 547 mil 260 votos, lo que significa un 19.08 por ciento más de los votos logrados por el actual gobernador, Francisco Vega de Lamadrid, en la elección de 2013, donde obtuvo el triunfo con 442 mil 868 sufragios a su favor.
El Partido Acción Nacional, en la segunda posición de la contienda electoral del 1 de julio de 2018 en Baja California, obtuvo –sumando los votos a favor de sus candidatos- 223 mil 258 votos, para obtener el 23.68 por ciento de preferencia en la elección, contra el 57.94 por ciento logrado por Morena.
Los candidatos del Partido Revolucionario Institucional a las diputaciones federales de Baja California, quedaron rezagados en la tercer posición con apenas el 9.25 por ciento de la votación a su favor, cifra similar a la lograda por su candidato a la Presidencia de la República, José Antonio Meade Kuribreña.
En momentos en que el tema de la corrupción y el desvío de fondos en los gobiernos, que no ha escapado al de Baja California, el Partido Acción Nacional ha sufrido una de sus peores derrotas. El Movimiento de Regeneración Nacional sepultó los ánimos de victoria de los panistas en Baja California, y mueve el mapa político con miras a las elecciones estatales que habrán de celebrarse el próximo año para renovar el Gobierno del Estado, las Presidencias Municipales y el Congreso del Estado.
Al lunes 2 de julio con más del 65 por ciento de las casillas computadas en el Estado, así van las votaciones:
| Distrito 1 |
| * Juan Salvador Minor Mora de Juntos Haremos Historia 74 mil 207 votos |
| * David de la Rosa Anaya, de Por México al Frente 35 mil 009 votos |
| * Celestino Salceda Flores, del PRI 9 mil 314 votos |
| * Marco Aurelio Gámez Servín del Verde Ecologista 5 mil 233 votos |
| * Jorge Alberto Martínez Carrillo de Nueva Alianza 3 mil 233 votos. |
| Distrito 2 | ||
| * Marina del Pilar Ávila Olmeda de Juntos Haremos Historia | 63 mil 084 votos | |
| * Mónica Bedoya Serna de Por México al Frente | 35 mil 598 votos | |
| * José Lauro Aréstegui Verdugo del PRI | 13 mil 005 votos | |
| * Alejandra Serna Castellanos del Verde Ecologista | 4 mil 443 votos | |
| * Miguel Alejandro Estrella Montoya de Alianza | 2 mil 351 votos | |
| Distrito 3 | ||
| *Armando Reyes Ledezma de Juntos Haremos Historia | 77 mil 833 votos | |
| *Jacinto Sánchez Caro de Por México al Frente | 36 mil 039 votos | |
| *Génesis Márquez Ruvalcaba, del PRI | 19 mil 192 votos | |
| *Carmen Lidia Salazar Guerra del Verde
*Francisco Alfredo Ortega Gamboa de Alianza |
7 mil 515 votos 5 mil 946
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| Distrito 4 | |
| Socorro Irma Andazola Gómez de Haremos Historia | 80 mil 368 votos |
| Ricardo Magaña Mosqueda del Por México al Frente | 19 mil 450 votos |
| Viancca Lizbeth Barreto González del PRI | 6 mil 379 votos |
| Mario Valero Hernández del Verde | 3 mil 151 votos |
| Blanca Nidia Inzunza Angulo de Alianza | 2 mil 460 votos |
| Distrito 5 | |
| Mario Ismael Moreno Gil de Morena | 75 mil 762 votos |
| Rosalba López Regalado del PAN | 37 mil 000 votos |
| Miguel Ángel Badiola Montaño del PRI | 12 mil 309 votos |
| Oscar Alberto Chávez García del Verde | 4 mil 574 votos |
| Víctor Parra Meza de Aliaza | 2 mil 425 votos |
| Distrito 6 | |
| Javier Julián Castañeda Pomposo de Morena | 46 mil 622 votos |
| Adriana Guadalupe Sánchez Martínez, del PAN | 19 mil 537 votos |
| Ana Erika Santana González del PRI | 7 mil 875 votos |
| Claudia Nieto Pérez del Verde | 2 mil 813 votos |
| Irma Yoseline Miranda Castro de Alianza | 1m 573 votos |
| Distrito 7 | |
| Erick Isaac Morales de Morena | 51 mil 386 votos |
| Juan Ramón López Naranjo del PAN | 19 mil 541 votos |
| Adriana López del PRI | 9 mil 831 votos |
| Juan Antonio Valencia del Verde | 2 mil 809 votos |
| Yesica García Valdez de Alianza | 2 mil 044 votos |
| Distrito 8 | |
| Héctor René Cruz Aparicio de Morena | 77 mil 036 votos |
| David Saul Guakil del PAN | 20 mil 727 votos |
| Jorge Mario Madrigal del PRI | 9 mil 338 votos |
| Karla Martínez Zendejas del Verde | 3 mil 199 votos |
| Lizbeth Guadalupe Pérez Ventura de Alianza | 2 mil 064 votos |
| BC | VOTOS | PORCENTAJE |
| MORENA | 547 mil 260 | 57.94% |
| PAN | 223 mil 258 | 23.63 % |
| PRI | 87 mil 401 | 9.25 % |
| VERDE | 33 mil 860 | 3.58 % |
| ALIANZA | 22 mil 136 | 2.34 % |
